MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 6460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017618	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017618	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017618	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017618	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017618	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017618	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017618	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017618	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017618	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017618	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017618	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017618	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017618	A	8	8	4390	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017618	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017618	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017618	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017618	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017618	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017618	AGG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017618	AAC	2	6	13085	13090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017618	CTA	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017618	T	6	6	15720	15725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017618	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017618	A	6	6	15868	15873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017618	CAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017618	GAA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017618	A	6	6	16551	16556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017618	A	6	6	16585	16590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017618	A	6	6	16595	16600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017618	GAT	2	6	16623	16628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017618	A	6	6	16674	16679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017618	AGA	2	6	16708	16713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017618	A	7	7	16763	16769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017618	A	6	6	16775	16780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017618	AAC	2	6	16838	16843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017618	AGA	2	6	16862	16867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017618	ACAA	2	8	16913	16920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017618	GGC	2	6	17005	17010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017618	GCA	2	6	17324	17329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017618	CGC	2	6	17371	17376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017618	GTGA	2	8	17377	17384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017618	TGT	2	6	17410	17415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017618	AGA	2	6	17419	17424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017618	AGA	2	6	17431	17436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017618	CAG	2	6	17493	17498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017618	AGCG	2	8	17548	17555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017618	AT	3	6	17677	17682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017618	GGA	2	6	17683	17688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017618	CT	3	6	17708	17713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017618	GAA	2	6	17947	17952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017618	GGT	2	6	18021	18026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017618	GTC	2	6	18035	18040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017618	TCGTG	2	10	18044	18053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017618	CAT	2	6	18103	18108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017618	TAA	2	6	18138	18143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017618	GGA	2	6	18147	18152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017618	ATC	2	6	18171	18176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017618	AC	3	6	18198	18203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017618	CGC	2	6	18337	18342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017618	AC	3	6	18367	18372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017618	CAC	2	6	18382	18387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017618	AGCC	2	8	18430	18437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017618	GAT	2	6	18453	18458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017618	CCT	2	6	18509	18514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017618	TCT	2	6	18544	18549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017618	AGG	2	6	18610	18615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017618	AAC	2	6	18645	18650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017618	GTT	2	6	18655	18660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017618	A	6	6	18790	18795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017618	ATC	2	6	18848	18853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017618	AGT	2	6	18856	18861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017618	GTTAA	2	10	18923	18932	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017618	ACG	2	6	18986	18991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017618	GTAA	2	8	19009	19016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017618	TCAC	2	8	19066	19073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017618	TAG	2	6	19157	19162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017618	GCGA	2	8	19165	19172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017618	AGG	2	6	19179	19184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017618	GAG	2	6	19192	19197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017618	CTC	2	6	19202	19207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017618	AGA	2	6	19244	19249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017618	AG	3	6	19272	19277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017618	T	6	6	19300	19305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017618	TCG	2	6	19347	19352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017618	GGA	2	6	19360	19365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017618	CT	3	6	19386	19391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017618	ACA	2	6	19478	19483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017618	ATG	2	6	19545	19550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017618	TAT	2	6	19610	19615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017618	GGA	2	6	19678	19683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017618	TC	3	6	19764	19769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017618	ACC	2	6	19944	19949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017618	AAT	2	6	19964	19969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017618	AGC	2	6	20024	20029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017618	ATTC	2	8	20031	20038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017618	TG	3	6	20155	20160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017618	AAG	2	6	20161	20166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017618	GAG	2	6	20176	20181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017618	GA	3	6	20306	20311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017618	ACA	2	6	20332	20337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017618	CTAA	2	8	20387	20394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017618	GA	3	6	20602	20607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017618	CT	3	6	20718	20723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017618	GAT	2	6	20736	20741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017618	AGG	2	6	20781	20786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017618	CGG	2	6	20827	20832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017618	GA	3	6	20925	20930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017618	TAGG	2	8	21043	21050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017618	TAC	2	6	21097	21102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017618	CCT	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017618	GGT	2	6	21321	21326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017618	TCG	2	6	21437	21442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017618	CGT	2	6	21517	21522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017618	GA	3	6	21741	21746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017618	TGGAAG	2	12	21764	21775	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017618	AGT	2	6	21908	21913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017618	CAG	2	6	21959	21964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017618	AGT	2	6	21985	21990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017618	AATC	2	8	22190	22197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017618	ACC	2	6	22509	22514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017618	CGT	2	6	22546	22551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017618	ATTAT	2	10	22860	22869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017618	CGC	2	6	22939	22944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017618	TA	3	6	22945	22950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017618	AT	3	6	23036	23041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017618	GGA	2	6	23043	23048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017618	GCGT	2	8	23102	23109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017618	TCC	2	6	23126	23131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017618	TAT	2	6	23136	23141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017618	AGC	2	6	23152	23157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017618	TCG	2	6	23166	23171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017618	CGG	2	6	23278	23283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017618	TAT	2	6	23326	23331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017618	GGT	2	6	23384	23389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017618	ATATT	2	10	23408	23417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017618	AT	3	6	23561	23566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017618	TAA	2	6	24915	24920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017618	T	7	7	24942	24948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017618	GA	3	6	24957	24962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017618	GAG	2	6	24976	24981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017618	TTTG	2	8	26289	26296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017618	AT	3	6	26336	26341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017618	AGG	2	6	26342	26347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017618	CTT	2	6	27344	27349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017618	T	6	6	27348	27353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017618	ATTT	2	8	27356	27363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017618	TAT	2	6	27372	27377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_017618	T	6	6	42779	42784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017618	TC	3	6	55207	55212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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435	NC_017618	GT	3	6	110494	110499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
436	NC_017618	GCA	2	6	110530	110535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_017618	TCA	2	6	110657	110662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_017618	TG	3	6	110697	110702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_017618	TTA	2	6	110876	110881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_017618	GAAA	2	8	118343	118350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017618	AT	4	8	118353	118360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017618	TCG	2	6	119103	119108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_017618	ATT	2	6	119808	119813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_017618	GAG	2	6	119862	119867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_017618	TTA	2	6	129259	129264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_017618	TTG	2	6	129647	129652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_017618	CTATA	2	10	133419	133428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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